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Prezado Vinicius,

Aqui funciona numa boa, note que um monitor widescreen tem a tendencia real de achavar as coisas, tendo em vista que a largura eh maior que a altura. Mas no meu sistema funciona normalmente, estou o utilizando o Ubuntu 6.10

O que posso fazer para te ajudar é, abra um console e digite xrand.
Minha saída está assim:
kadu@ideafix:~$ xrandr
SZ: Pixels Physical Refresh
*0 1280 x 800 ( 332mm x 212mm ) *60
1 1024 x 768 ( 332mm x 212mm ) 60
2 800 x 600 ( 332mm x 212mm ) 60
3 640 x 480 ( 332mm x 212mm ) 60
Current rotation - normal
Current reflection - none
Rotations possible - normal left inverted right
Reflections possible - none

Verifique a sua e veja se está com 1280x800 mesmo.
Outra coisa q vc pode fazer é gerar um screen shoot da sua tela e visualiza-lo em outro computador, vc terá alguma noção do que ocorre devido ao formato do monitor.

Qualquer coisa posta aih.

abraços